Neznám sice odpověď na tvou otázku (nejspíš to jde), ale přijde mi to zbytečné. Dnešním trendem je psát všechny poznámky i dokumentaci přímo do kódu programu.
Jaké poznámky máš na mysli?
Jak říká Kit, poznámky by měly být ve formě komentářů u příslušných metod a tříd. V NetBeans si určitě txt otevřeš, ale tam bych si psal max TODOčko.
Asi máte pravdu.Budu to psát tam, je lepší se to naučit už na
začátku.Ještě taková doplňující otázka: Je lepší NetBeans nebo
Eclipse? 
Ahoj, ve svých začátcích jsem používal NetBeans. Teď používám
Eclipse v poslední verzi. Rozdíl mezi nimy pro začátečníky néni. Pokud
ale uvažuješ nad vývojem aplikací například pro android. Je lepší
eclipse.
Eclipse má více pluginů pro další jazyky. Je jednoduší. Nemá tolik
nabídek v základní verzi- začátečník se neztratí. Mnoho velkých firem
ho používá. Např RedHat, IBM. Eclipse vyvíjí IBM a komunita.
NetBeans je profesionální nástroj od prvního spuštění. Obsahuje spoustu
klikátek, nabídek, tlačítek. Člověk se v tom ztrácí. Má několik
oficiálních pluginů. Již jde vyvíjet v něm i pro Android (raději bych ale
zvolil eclipse). Výhodou je vývoj přímo "výrobce" javy. Do svého programu
dává novinky atd. Vyvíjí ho Oracle, dříve Sun.
Zkus si obě IDE a porovnej. Pro tebe bych ale volil Eclipse
Mnozí programátoři píší TODO také přímo do zdrojáků, ovšem mimo dokumentační komentáře. Grepem se to velmi dobře hledá a hned je vidět, kterého zdrojáku se to týká.
Ahoj.Nainstaloval sem Eclipse a po minutách odinstaloval NetBeans 
. Je
rychlejší,přehlednější,čistší nezabírá tolik místa a mám pocit
že je skromnější i na výkon. Navíc se mi líbí jeho filozofie. Děkuju za
tip 
Na můj názor na NetBeans se raději neptej, nevím, jak bych ho slušně
mohl vyjádřit, protože takový šmejd se jen tak nevidí. Na druhou stranu v
něm dělá hodně lidí (nechápu to, někdy bych v tom chtěl vidět někoho
pracovat, jak se mu 10 minut generuje prázdná třída), proto je o něm zde na
IS zmínka. S Eclipse jsem nedělal, ale slyšel jsem samou chválu
Zobrazeno 9 zpráv z 9.